Предыдущая тема :: Следующая тема |
Автор |
Сообщение |
pooha
Главная хулиганка Сибмамы
На сайте с 29.09.03 Сообщения: 18397 В дневниках: 20255 Откуда: Академ
|
Добавлено: Чт Сен 06, 2007 19:31 Заголовок сообщения: Кстати, о цвете глаз |
|
|
Собственный геном обескуражил великого генетика
Впервые расшифрованный геном реального, а не «условного», человека, к тому же видного генетика, обескуражил его самого – тот не смог методами генетики определить даже цвет собственных глаз.
Исследовательская группа института Дж. Крейга Вентера (J. Craig Venter Institute) в сотрудничестве со специалистами детского госпиталя Торонто и Калифорнийского университета в г. Сан-Диего впервые опубликовали секвенированную последовательность генома реального человека – самого Крейга Вентера, основателя знаменитой в свое время компании Celera. Результаты обескуражили даже его самого. Ранее, в 2001 году, генетики уже сообщили об успешной расшифровке генотипа человека. Однако в том случае речь шла скорее об «условном» человеческом геноме – он представлял собой обобщенный результат расшифровки генов, взятых из ДНК различных людей.
Теперь и мировая генетика, и сам Крейг Вентер получили результаты расшифровки первого «полноценного» диплоидного генома конкретного человека – так называемую HuRef-версию человеческого генома. В частности, удалось впервые с 96% покрытием исследовать части генома, полученные доктором Вентером и от отца, и от матери.
Как сообщает Reuters, результаты проведенного исследования сильно обескуражили его самого. Как признается д-р Вентер, из анализа генома не удалось даже определить цвет его глаз. У Крейга Вентера генетический код отличался от «обобщенного» генотипа человека на 4,1 млн. участков.
Единственный вывод, который пока что удалось сделать ученым – это то, что генотипы людей различаются между собой значительно больше, чем утверждала генетика ранее и чем она готова допустить. По мнению д-ра Вентера, вариации человеческого генотипа от человека к человеку могут как минимум в семь раз превосходить прежние оценки. Возможно, что в дальнейшем эти оценки станут даже более пессимистичными.
Последние открытия ученых все чаще ставят под сомнение фундаментальные принципы, лежащие в основе генетики – и, в частности, представление о том, что информация о видовой принадлежности организма передается через его генотип. Так, выяснилось, что особи классического объекта генетических исследований – растения резуховидки (Arabidopsis thaliana), геном которой был расшифрован еще раньше, чем геном д-ра Вентера, могут иметь совершенно различные геномы, но при этом оставаться представителями одного и того же биологического вида.
Степень генных различий между резуховидками, произрастающими в различных географических районах, намного превосходит допустимую. Но при этом все указанные особи как были резуховидками, так ими и остаются.
И резуховидка - не единственный вид на Земле, существование которого явно противоречит принципам современной генетики.
Все это означает, что гены в конечном счете могут оказаться совсем не тем, чем они представляются с точки зрения современной генетики. Подробная информация о драматических событиях в мире генетики будет представлена на портале Исследования и разработки – R&D.CNews._________________ "Естественное желание хороших людей -добывать знание" Л. да Винчи |
|
Вернуться к началу |
|
|
Elena_V
Аспирант Сибмамы
На сайте с 17.10.05 Сообщения: 3931 В дневниках: 29 Откуда: Новосибирск, Академгородок, Щ
|
Добавлено: Чт Сен 06, 2007 21:54 |
|
|
Хм интересно, но думаю этому факту скоро найдут объяснения. Вполне вероятно это будет ошибкой метода. Сильно сомневаюсь что в данном случае "неправы" основы генетики. |
|
Вернуться к началу |
|
|
pooha
Главная хулиганка Сибмамы
На сайте с 29.09.03 Сообщения: 18397 В дневниках: 20255 Откуда: Академ
|
|
Вернуться к началу |
|
|
Elena_V
Аспирант Сибмамы
На сайте с 17.10.05 Сообщения: 3931 В дневниках: 29 Откуда: Новосибирск, Академгородок, Щ
|
Добавлено: Пт Сен 07, 2007 23:09 |
|
|
Цитата: | Нет, по-моему не правы были те, кто слишком большие надежды возлагал на секвенирование генома. Интересны не единичные последовательности, а спектр возможных вариантов ИМХО. |
Здесь я согласна, но то что написано в данном сообщении подвергаю сомнению (надо найти источник и прочитать научную статью). Ведь если вариации касаются некодирующей части генома, то каких-то четких определений сколько там считали есть различий до полного секвенирования быть не могло. Ну могло но это были оценки. И классических принципов генетики это никак не касается. |
|
Вернуться к началу |
|
|
pooha
Главная хулиганка Сибмамы
На сайте с 29.09.03 Сообщения: 18397 В дневниках: 20255 Откуда: Академ
|
|
Вернуться к началу |
|
|
Elena_V
Аспирант Сибмамы
На сайте с 17.10.05 Сообщения: 3931 В дневниках: 29 Откуда: Новосибирск, Академгородок, Щ
|
Добавлено: Вс Сен 09, 2007 21:27 |
|
|
Цитата: | Про принципы генетики я имела в виду нейтральную эволюцию некодирующих последовательностей |
Ааа здесь согласна. Просто мы разные вещи имели в виду. В моем понимании догмы - это законы Менделя, генетический код и т.д. |
|
Вернуться к началу |
|
|
pooha
Главная хулиганка Сибмамы
На сайте с 29.09.03 Сообщения: 18397 В дневниках: 20255 Откуда: Академ
|
Добавлено: Пн Сен 17, 2007 13:52 |
|
|
Вот вроде нашла исходную информацию, почитаю ещё.
PLoS Biol. 2007 Sep 4;5(10):e254
The Diploid Genome Sequence of an Individual Human.
Levy S, Sutton G, Ng PC, Feuk L, Halpern AL, Walenz BP, Axelrod N, Huang J, Kirkness EF, Denisov G, Lin Y, Macdonald JR, Pang AW, Shago M, Stockwell TB, Tsiamouri A, Bafna V, Bansal V, Kravitz SA, Busam DA, Beeson KY, McIntosh TC, Remington KA, Abril JF, Gill J, Borman J, Rogers YH, Frazier ME, Scherer SW, Strausberg RL, Venter JC.
Presented here is a genome sequence of an individual human. It was produced from approximately 32 million random DNA fragments, sequenced by Sanger dideoxy technology and assembled into 4,528 scaffolds, comprising 2,810 million bases (Mb) of contiguous sequence with approximately 7.5-fold coverage for any given region. We developed a modified version of the Celera assembler to facilitate the identification and comparison of alternate alleles within this individual diploid genome. Comparison of this genome and the National Center for Biotechnology Information human reference assembly revealed more than 4.1 million DNA variants, encompassing 12.3 Mb. These variants (of which 1,288,319 were novel) included 3,213,401 single nucleotide polymorphisms (SNPs), 53,823 block substitutions (2-206 bp), 292,102 heterozygous insertion/deletion events (indels)(1-571 bp), 559,473 homozygous indels (1-82,711 bp), 90 inversions, as well as numerous segmental duplications and copy number variation regions. Non-SNP DNA variation accounts for 22% of all events identified in the donor, however they involve 74% of all variant bases. This suggests an important role for non-SNP genetic alterations in defining the diploid genome structure. Moreover, 44% of genes were heterozygous for one or more variants. Using a novel haplotype assembly strategy, we were able to span 1.5 Gb of genome sequence in segments >200 kb, providing further precision to the diploid nature of the genome. These data depict a definitive molecular portrait of a diploid human genome that provides a starting point for future genome comparisons and enables an era of individualized genomic information
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez?Db=pubmed&Cmd=ShowDetailView&TermToSearch=17803354&ordinalpos=1&itool=EntrezSystem2.PEntrez.Pubmed.Pubmed_ResultsPanel.Pubmed_RVDocSum
А вообще у меня, конечно, ассоциация по диагонали тут пошла. Последнее время часто попадаются работы, где сравнивают полные геномы разных организмов, при этом всегда выясняется, что кодирующие участки менее консервативны, чем некодирующие, особенно фланкирующие. Вот я про догмы и пишу _________________ "Естественное желание хороших людей -добывать знание" Л. да Винчи |
|
Вернуться к началу |
|
|
2rk
молодой папа
На сайте с 01.03.09 Сообщения: 179 В дневниках: 1 Откуда: Микрорайон № 6 " Родники"
|
|
Вернуться к началу |
|
|
Elena_V
Аспирант Сибмамы
На сайте с 17.10.05 Сообщения: 3931 В дневниках: 29 Откуда: Новосибирск, Академгородок, Щ
|
Добавлено: Вс Мар 22, 2009 1:36 |
|
|
Кстати сейчас уже определены 24 полиморфных локуса (в народе мутации) которые ответственны за наследование цвета глаз. Так что теперь вышеназванный ученый может определить цвет своих глаз . Исследование правда европейское надо еще подтвердить его актуальность для нашей популяции. |
|
Вернуться к началу |
|
|
Pelinata
Детский сад
На сайте с 04.12.09 Сообщения: 151 Откуда: Казенная Заимка
|
Добавлено: Пт Дек 11, 2009 22:02 |
|
|
Я где то читала эту статью, думаю что рано или поздно, нам объяснят почему именно так) |
|
Вернуться к началу |
|
|
IIep4uHka
Ясельки
На сайте с 23.03.10 Сообщения: 35
|
Добавлено: Пт Мар 26, 2010 23:05 |
|
|
Жутко интересно. Только не все поняла. Поищу первоисточники. |
|
Вернуться к началу |
|
|
|
|
Вы не можете начинать темы Вы не можете отвечать на сообщения Вы не можете редактировать свои сообщения Вы не можете удалять свои сообщения Вы не можете голосовать в опросах
|
|